在世界上許多地方，種植者使用殺蟲劑控制咖啡害蟲生長，往往高海拔地區潮溼、多霧咖啡更易受
害蟲侵害，故種植者常用
殺蟲劑處理。 許多人認爲咖啡生長期間只要未使用合成殺蟲劑、除草劑和化學肥料就可以稱爲
有機咖啡豆，實際上，只有在第三方（除咖啡製造者和採購商外）認證完畢的情況下才能稱爲有機咖啡豆。
Organic Coffee 有機咖啡，及授權
有機咖啡Certified Organic Coffee是被第三方機構授權，是咖啡樹生長過程中，無化學原料不用農藥、
殺蟲劑、除草劑及人工食物添加劑種植的；從土壤水質檢測、種植、培育、採收、生產都必須符合有機的條件、過程嚴格控管，是與大自然和諧共存下生產出來的高品質咖啡，對健康及環保都有很大的益處。
世界上只有很少部分的咖啡是真正意義上的有機認證咖啡，因爲這個認證過程耗時相當長，大約三年時間。並且此種交易會造成咖啡產量下降多達50%。所以說，當咖啡種植者決定進行有機認證的話，也就意味着一場耗時、耗財的投資開始了。
咖啡有益健康的好處越來越多
2 型糖尿病 2010 年日本公佈的一項研究發現飲用咖啡可以預防 2 型糖尿病；2012 年德國發表於《美國臨牀營養期刊》的一項研究進一步證實這個結論。研究人員還發現，咖啡可以加倍促進葡萄糖的吸收，從而顯著降低血糖水平。
帕金森氏症 咖啡可以明顯降低帕金森氏症風險。實際上，咖啡能夠非常有效地預防帕金森氏症，很多製藥公司試圖通過模擬咖啡對大腦的益處來開發有效的試驗藥物
阿茲海默氏症 2011 年的一項研究 發現咖啡中有一種未知的神祕原料可與咖啡因相互作用，幫助預防阿茲海默氏症
前列腺癌 2011 年的一項大型研究 調查了近 50,000 名男性，結果發現每天喝六杯咖啡可以將患致命前列腺癌的風險降低 60%，每天喝三杯可以降低 30%
肝癌 日本的一項研究 發現，每天或經常喝咖啡的人患肝細胞癌 （HCC） 的風險比從不喝咖啡的人低一半；咖啡還可以緩解嚴重的肝纖維化，降低肝臟的脂肪水平和減慢丙型肝炎的進展速度
腎癌 飲用咖啡可以降低腎癌風險
結腸直腸癌 2007 年的一項研究 認爲飲用咖啡可以降低女性患結腸癌的風險
心律問題 研究顯示，適度飲用咖啡可以降低心律問題出現的幾率
肺功能 2010 年的一項研究 揭示了咖啡對非吸菸者肺功能的有利影響
中風 2011 年的一項研究 發現，每天喝一杯以上咖啡的女性中風的可能性比喝得更少的女性低 25%；2009 年的一項研究 發現，每天喝四杯或更多咖啡的女性中風的風險低 20%
胃腸菌羣 2009 年的一項研究 顯示，咖啡可以促進新陳代謝活動和/或增加雙歧桿菌的數量，雙歧桿菌是腸道中的一種有益細菌
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